１９９６（Ｈ８）年３月１６日にＫＴＲ・宮津線電化開業により、それまでキハ５８系で運転されていた急行「みやづ」に代わり運転を開始。運転開始当初は１往復半の上り２本（２・４号）、下り１本（１号）の設定で、１・４号がＧ編成、２号がＴ編成での運転でした。

１９９９（Ｈ１１）年１０月２日改正で上り１本・２号が廃止になり１往復の運転に。上下列車共にＧ編成での運用となりました。

２００３（Ｈ１５）年１０月１日改正で上りの２号がA編成に置き換えられ上下で塗色の違う編成の使用となりました。翌２００４（Ｈ１６）３月１３日改正でA編成文殊が通年４連に減車され、以後列車廃止となる２０１１（Ｈ２３）３月１１日までの運用形態が続きました。
　　　　　　　
　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　Ｇ編成時代の上り「文殊」（Ｇ６３編成）
　　　　　　　　　　　
　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　Ｔ編成時代の「文殊」（Ｔ４５編成）
　　　　　　　　
　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　貫通クハ先頭６連の上り「文殊」（A４２編成）
　　　　　　　　　
　　　　　　　　　　　　　　　　　　４８５系増結ユニット組み込みの６連「文殊」（A４２編成）
　　　　　　　
　　　　　　　　　　　　　　　　　　　非貫通クハ先頭の上り４連「文殊」（A４６編成）
　　　　　　　　　
　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　非貫通クハ先頭の上り６連混色「文殊」（A４７編成）
　　　　　　　
　　　　　　　　　　　　　　　　　　大阪方クハのみＢ編成色の上り「文殊」（A４４編成）
　　　　　　　　
　　　　　　　
　　　　　　　　　　同じダイヤ改正で福知山線から去った「タンゴエクスプローラー」号との離合。　　　　　　
　　　　　　　
　　　　　　　　　　　　　タンゴエクスプローラー号の代走を勤めるＫＴＲ８０００系との離合。
　　　　　　　
　　　　　　　　　　　　　　　　　同じくダイヤ改正で終焉を迎える４８５系「雷鳥」との並び。
　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　尼崎付近で離合する上下「文殊」

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